Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV87

CNPPD1, Protein CNPPD1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPPD1Q9BV87 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNPPD1Q9BV87 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNPPD1Q9BV87 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms