Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms