Protein–RNA interactions for Protein: Q86T20

SMIM29, Uncharacterized protein SMIM29, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM29Q86T20 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms