Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP3

MLIP, Muscular LMNA-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLIPQ5VWP3 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MLIPQ5VWP3 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms