Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYB3

FOXD4L6, Forkhead box protein D4-like 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L6Q3SYB3 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXD4L6Q3SYB3 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXD4L6Q3SYB3 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXD4L6Q3SYB3 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXD4L6Q3SYB3 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXD4L6Q3SYB3 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXD4L6Q3SYB3 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXD4L6Q3SYB3 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXD4L6Q3SYB3 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXD4L6Q3SYB3 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXD4L6Q3SYB3 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXD4L6Q3SYB3 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXD4L6Q3SYB3 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXD4L6Q3SYB3 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXD4L6Q3SYB3 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXD4L6Q3SYB3 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXD4L6Q3SYB3 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXD4L6Q3SYB3 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXD4L6Q3SYB3 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXD4L6Q3SYB3 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXD4L6Q3SYB3 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXD4L6Q3SYB3 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXD4L6Q3SYB3 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXD4L6Q3SYB3 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXD4L6Q3SYB3 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXD4L6Q3SYB3 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXD4L6Q3SYB3 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXD4L6Q3SYB3 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXD4L6Q3SYB3 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXD4L6Q3SYB3 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXD4L6Q3SYB3 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXD4L6Q3SYB3 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXD4L6Q3SYB3 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXD4L6Q3SYB3 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXD4L6Q3SYB3 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXD4L6Q3SYB3 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXD4L6Q3SYB3 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXD4L6Q3SYB3 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXD4L6Q3SYB3 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXD4L6Q3SYB3 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXD4L6Q3SYB3 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXD4L6Q3SYB3 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXD4L6Q3SYB3 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXD4L6Q3SYB3 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXD4L6Q3SYB3 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXD4L6Q3SYB3 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXD4L6Q3SYB3 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXD4L6Q3SYB3 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXD4L6Q3SYB3 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXD4L6Q3SYB3 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXD4L6Q3SYB3 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXD4L6Q3SYB3 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXD4L6Q3SYB3 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXD4L6Q3SYB3 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXD4L6Q3SYB3 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXD4L6Q3SYB3 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXD4L6Q3SYB3 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXD4L6Q3SYB3 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXD4L6Q3SYB3 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXD4L6Q3SYB3 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXD4L6Q3SYB3 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXD4L6Q3SYB3 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXD4L6Q3SYB3 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXD4L6Q3SYB3 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXD4L6Q3SYB3 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXD4L6Q3SYB3 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXD4L6Q3SYB3 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXD4L6Q3SYB3 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXD4L6Q3SYB3 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXD4L6Q3SYB3 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXD4L6Q3SYB3 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXD4L6Q3SYB3 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXD4L6Q3SYB3 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXD4L6Q3SYB3 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXD4L6Q3SYB3 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXD4L6Q3SYB3 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXD4L6Q3SYB3 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXD4L6Q3SYB3 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXD4L6Q3SYB3 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXD4L6Q3SYB3 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXD4L6Q3SYB3 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXD4L6Q3SYB3 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXD4L6Q3SYB3 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXD4L6Q3SYB3 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FOXD4L6Q3SYB3 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FOXD4L6Q3SYB3 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FOXD4L6Q3SYB3 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FOXD4L6Q3SYB3 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FOXD4L6Q3SYB3 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FOXD4L6Q3SYB3 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FOXD4L6Q3SYB3 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FOXD4L6Q3SYB3 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FOXD4L6Q3SYB3 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
FOXD4L6Q3SYB3 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FOXD4L6Q3SYB3 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FOXD4L6Q3SYB3 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FOXD4L6Q3SYB3 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FOXD4L6Q3SYB3 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FOXD4L6Q3SYB3 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FOXD4L6Q3SYB3 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms