Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VPS72Q15906 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VPS72Q15906 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VPS72Q15906 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
VPS72Q15906 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
VPS72Q15906 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
VPS72Q15906 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
VPS72Q15906 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
VPS72Q15906 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
VPS72Q15906 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
VPS72Q15906 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
VPS72Q15906 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
VPS72Q15906 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
VPS72Q15906 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
VPS72Q15906 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
VPS72Q15906 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
VPS72Q15906 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
VPS72Q15906 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VPS72Q15906 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
VPS72Q15906 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VPS72Q15906 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VPS72Q15906 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
VPS72Q15906 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VPS72Q15906 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
VPS72Q15906 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
VPS72Q15906 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
VPS72Q15906 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VPS72Q15906 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VPS72Q15906 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VPS72Q15906 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
VPS72Q15906 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
VPS72Q15906 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VPS72Q15906 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
VPS72Q15906 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
VPS72Q15906 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VPS72Q15906 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
VPS72Q15906 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VPS72Q15906 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VPS72Q15906 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
VPS72Q15906 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
VPS72Q15906 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
VPS72Q15906 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VPS72Q15906 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VPS72Q15906 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VPS72Q15906 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VPS72Q15906 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
VPS72Q15906 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
VPS72Q15906 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
VPS72Q15906 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VPS72Q15906 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
VPS72Q15906 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC21■□□□□ 0.95
VPS72Q15906 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
VPS72Q15906 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VPS72Q15906 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC21■□□□□ 0.95
VPS72Q15906 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
VPS72Q15906 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
VPS72Q15906 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
VPS72Q15906 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
VPS72Q15906 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VPS72Q15906 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
VPS72Q15906 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
VPS72Q15906 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
VPS72Q15906 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
VPS72Q15906 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VPS72Q15906 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VPS72Q15906 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
VPS72Q15906 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VPS72Q15906 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
VPS72Q15906 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
VPS72Q15906 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
VPS72Q15906 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
VPS72Q15906 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VPS72Q15906 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VPS72Q15906 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VPS72Q15906 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VPS72Q15906 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
VPS72Q15906 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VPS72Q15906 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
VPS72Q15906 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VPS72Q15906 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
VPS72Q15906 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VPS72Q15906 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
VPS72Q15906 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
VPS72Q15906 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
VPS72Q15906 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
VPS72Q15906 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
VPS72Q15906 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
VPS72Q15906 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
VPS72Q15906 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VPS72Q15906 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
VPS72Q15906 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VPS72Q15906 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VPS72Q15906 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VPS72Q15906 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VPS72Q15906 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
VPS72Q15906 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
VPS72Q15906 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
VPS72Q15906 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
VPS72Q15906 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
VPS72Q15906 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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