Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms