Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LOXL3P58215 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms