Protein–RNA interactions for Protein: P53667

LIMK1, LIM domain kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK1P53667 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIMK1P53667 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIMK1P53667 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIMK1P53667 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIMK1P53667 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIMK1P53667 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIMK1P53667 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIMK1P53667 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIMK1P53667 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIMK1P53667 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIMK1P53667 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIMK1P53667 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIMK1P53667 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIMK1P53667 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LIMK1P53667 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIMK1P53667 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIMK1P53667 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIMK1P53667 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIMK1P53667 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIMK1P53667 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIMK1P53667 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIMK1P53667 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIMK1P53667 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIMK1P53667 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIMK1P53667 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIMK1P53667 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIMK1P53667 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIMK1P53667 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIMK1P53667 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIMK1P53667 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LIMK1P53667 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIMK1P53667 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIMK1P53667 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIMK1P53667 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIMK1P53667 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIMK1P53667 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIMK1P53667 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIMK1P53667 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIMK1P53667 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIMK1P53667 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIMK1P53667 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIMK1P53667 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIMK1P53667 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LIMK1P53667 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIMK1P53667 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIMK1P53667 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIMK1P53667 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIMK1P53667 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIMK1P53667 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIMK1P53667 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIMK1P53667 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIMK1P53667 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIMK1P53667 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIMK1P53667 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIMK1P53667 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIMK1P53667 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIMK1P53667 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIMK1P53667 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIMK1P53667 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIMK1P53667 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIMK1P53667 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LIMK1P53667 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LIMK1P53667 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LIMK1P53667 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LIMK1P53667 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LIMK1P53667 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LIMK1P53667 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LIMK1P53667 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
LIMK1P53667 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LIMK1P53667 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LIMK1P53667 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LIMK1P53667 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LIMK1P53667 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LIMK1P53667 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LIMK1P53667 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LIMK1P53667 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LIMK1P53667 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LIMK1P53667 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LIMK1P53667 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LIMK1P53667 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LIMK1P53667 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LIMK1P53667 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LIMK1P53667 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LIMK1P53667 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LIMK1P53667 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LIMK1P53667 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LIMK1P53667 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LIMK1P53667 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LIMK1P53667 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LIMK1P53667 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LIMK1P53667 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LIMK1P53667 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LIMK1P53667 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LIMK1P53667 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LIMK1P53667 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LIMK1P53667 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LIMK1P53667 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LIMK1P53667 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LIMK1P53667 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LIMK1P53667 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms