Protein–RNA interactions for Protein: P32248

CCR7, C-C chemokine receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR7P32248 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCR7P32248 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCR7P32248 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCR7P32248 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCR7P32248 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCR7P32248 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCR7P32248 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCR7P32248 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CCR7P32248 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCR7P32248 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCR7P32248 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCR7P32248 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCR7P32248 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCR7P32248 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCR7P32248 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCR7P32248 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCR7P32248 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCR7P32248 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCR7P32248 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCR7P32248 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCR7P32248 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCR7P32248 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CCR7P32248 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCR7P32248 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCR7P32248 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCR7P32248 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCR7P32248 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCR7P32248 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCR7P32248 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCR7P32248 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCR7P32248 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCR7P32248 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCR7P32248 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCR7P32248 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCR7P32248 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCR7P32248 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCR7P32248 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR7P32248 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR7P32248 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR7P32248 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR7P32248 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR7P32248 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR7P32248 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR7P32248 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR7P32248 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR7P32248 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR7P32248 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR7P32248 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR7P32248 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR7P32248 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR7P32248 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR7P32248 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR7P32248 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR7P32248 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR7P32248 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR7P32248 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR7P32248 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR7P32248 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR7P32248 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR7P32248 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR7P32248 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR7P32248 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR7P32248 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR7P32248 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR7P32248 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR7P32248 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR7P32248 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR7P32248 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR7P32248 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR7P32248 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR7P32248 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR7P32248 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR7P32248 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR7P32248 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCR7P32248 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCR7P32248 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCR7P32248 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCR7P32248 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCR7P32248 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCR7P32248 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCR7P32248 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCR7P32248 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCR7P32248 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCR7P32248 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCR7P32248 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCR7P32248 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCR7P32248 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCR7P32248 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCR7P32248 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCR7P32248 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCR7P32248 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCR7P32248 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCR7P32248 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCR7P32248 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCR7P32248 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCR7P32248 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCR7P32248 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCR7P32248 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCR7P32248 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCR7P32248 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms