Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC20■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC20■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC20■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MED23Q9ULK4 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms