Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRRC8EQ6NSJ5 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms