Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC153Q494R4 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms