Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms