Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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HIF1AQ16665 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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HIF1AQ16665 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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HIF1AQ16665 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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HIF1AQ16665 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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HIF1AQ16665 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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HIF1AQ16665 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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HIF1AQ16665 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
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HIF1AQ16665 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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