Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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NCF4Q15080 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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NCF4Q15080 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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NCF4Q15080 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
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NCF4Q15080 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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NCF4Q15080 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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NCF4Q15080 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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NCF4Q15080 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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