Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
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