Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC173Q0VFZ6 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms