Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms