Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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PUDPQ08623 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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PUDPQ08623 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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PUDPQ08623 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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PUDPQ08623 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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PUDPQ08623 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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PUDPQ08623 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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PUDPQ08623 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PUDPQ08623 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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