Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPC3P51654 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPC3P51654 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPC3P51654 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPC3P51654 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GPC3P51654 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPC3P51654 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GPC3P51654 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPC3P51654 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPC3P51654 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GPC3P51654 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPC3P51654 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPC3P51654 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPC3P51654 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GPC3P51654 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GPC3P51654 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GPC3P51654 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GPC3P51654 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GPC3P51654 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GPC3P51654 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
GPC3P51654 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GPC3P51654 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GPC3P51654 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GPC3P51654 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GPC3P51654 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GPC3P51654 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GPC3P51654 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GPC3P51654 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPC3P51654 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPC3P51654 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPC3P51654 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPC3P51654 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPC3P51654 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPC3P51654 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPC3P51654 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPC3P51654 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPC3P51654 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPC3P51654 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPC3P51654 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPC3P51654 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPC3P51654 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPC3P51654 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPC3P51654 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPC3P51654 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPC3P51654 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPC3P51654 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPC3P51654 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPC3P51654 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPC3P51654 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPC3P51654 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPC3P51654 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPC3P51654 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPC3P51654 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GPC3P51654 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPC3P51654 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPC3P51654 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GPC3P51654 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPC3P51654 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPC3P51654 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPC3P51654 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPC3P51654 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPC3P51654 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPC3P51654 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPC3P51654 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPC3P51654 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GPC3P51654 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GPC3P51654 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GPC3P51654 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GPC3P51654 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GPC3P51654 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GPC3P51654 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GPC3P51654 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GPC3P51654 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GPC3P51654 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GPC3P51654 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GPC3P51654 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GPC3P51654 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GPC3P51654 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GPC3P51654 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GPC3P51654 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GPC3P51654 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GPC3P51654 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GPC3P51654 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GPC3P51654 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GPC3P51654 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GPC3P51654 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
GPC3P51654 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GPC3P51654 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
GPC3P51654 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GPC3P51654 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GPC3P51654 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GPC3P51654 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GPC3P51654 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GPC3P51654 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GPC3P51654 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GPC3P51654 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GPC3P51654 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GPC3P51654 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GPC3P51654 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GPC3P51654 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms