Protein–RNA interactions for Protein: P36871

PGM1, Phosphoglucomutase-1, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGM1P36871 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGM1P36871 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGM1P36871 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PGM1P36871 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGM1P36871 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGM1P36871 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGM1P36871 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGM1P36871 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGM1P36871 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGM1P36871 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGM1P36871 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGM1P36871 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGM1P36871 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGM1P36871 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGM1P36871 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGM1P36871 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGM1P36871 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGM1P36871 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGM1P36871 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGM1P36871 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGM1P36871 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGM1P36871 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGM1P36871 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGM1P36871 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PGM1P36871 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGM1P36871 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGM1P36871 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGM1P36871 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGM1P36871 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGM1P36871 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PGM1P36871 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGM1P36871 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGM1P36871 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PGM1P36871 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PGM1P36871 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGM1P36871 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGM1P36871 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PGM1P36871 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PGM1P36871 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGM1P36871 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGM1P36871 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGM1P36871 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGM1P36871 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PGM1P36871 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGM1P36871 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGM1P36871 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGM1P36871 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGM1P36871 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGM1P36871 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGM1P36871 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGM1P36871 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGM1P36871 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGM1P36871 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGM1P36871 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGM1P36871 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PGM1P36871 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGM1P36871 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGM1P36871 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGM1P36871 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGM1P36871 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PGM1P36871 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
PGM1P36871 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PGM1P36871 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PGM1P36871 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PGM1P36871 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PGM1P36871 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PGM1P36871 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PGM1P36871 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PGM1P36871 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGM1P36871 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGM1P36871 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGM1P36871 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGM1P36871 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGM1P36871 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGM1P36871 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGM1P36871 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGM1P36871 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGM1P36871 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGM1P36871 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PGM1P36871 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGM1P36871 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGM1P36871 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGM1P36871 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGM1P36871 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGM1P36871 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGM1P36871 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGM1P36871 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGM1P36871 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGM1P36871 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGM1P36871 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PGM1P36871 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGM1P36871 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGM1P36871 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGM1P36871 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGM1P36871 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGM1P36871 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGM1P36871 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGM1P36871 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PGM1P36871 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGM1P36871 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms