Protein–RNA interactions for Protein: P19387

POLR2C, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2CP19387 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2CP19387 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms