Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms