Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXP7

GIN1, Gypsy retrotransposon integrase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIN1Q9NXP7 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GIN1Q9NXP7 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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