Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CEP44Q9C0F1 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms