Protein–RNA interactions for Protein: Q96LS8

C2orf48, Uncharacterized protein C2orf48, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf48Q96LS8 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC11.02□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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C2orf48Q96LS8 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
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C2orf48Q96LS8 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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C2orf48Q96LS8 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
C2orf48Q96LS8 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC11.01□□□□□ -0.65
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