Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms