Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2W1

PDZK1, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF3, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1Q5T2W1 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms