Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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