Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
BNIP3Q12983 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms