Protein–RNA interactions for Protein: Q00266

MAT1A, S-adenosylmethionine synthase isoform type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAT1AQ00266 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms