Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CRATP43155 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CRATP43155 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRATP43155 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRATP43155 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRATP43155 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRATP43155 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRATP43155 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRATP43155 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRATP43155 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRATP43155 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRATP43155 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRATP43155 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRATP43155 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRATP43155 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRATP43155 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRATP43155 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRATP43155 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRATP43155 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRATP43155 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRATP43155 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRATP43155 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRATP43155 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRATP43155 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRATP43155 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRATP43155 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRATP43155 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRATP43155 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRATP43155 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRATP43155 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRATP43155 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRATP43155 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRATP43155 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRATP43155 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRATP43155 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRATP43155 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRATP43155 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRATP43155 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRATP43155 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRATP43155 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRATP43155 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRATP43155 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRATP43155 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRATP43155 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRATP43155 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRATP43155 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRATP43155 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRATP43155 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRATP43155 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CRATP43155 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRATP43155 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRATP43155 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRATP43155 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRATP43155 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRATP43155 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRATP43155 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRATP43155 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRATP43155 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRATP43155 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRATP43155 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRATP43155 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CRATP43155 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRATP43155 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRATP43155 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRATP43155 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRATP43155 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRATP43155 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRATP43155 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRATP43155 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRATP43155 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRATP43155 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRATP43155 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRATP43155 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRATP43155 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRATP43155 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRATP43155 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRATP43155 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRATP43155 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRATP43155 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRATP43155 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRATP43155 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRATP43155 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRATP43155 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CRATP43155 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRATP43155 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRATP43155 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRATP43155 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRATP43155 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRATP43155 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CRATP43155 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CRATP43155 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRATP43155 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CRATP43155 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CRATP43155 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CRATP43155 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CRATP43155 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CRATP43155 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CRATP43155 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CRATP43155 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CRATP43155 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms