Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP2P42575 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP2P42575 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP2P42575 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP2P42575 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP2P42575 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP2P42575 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP2P42575 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP2P42575 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP2P42575 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP2P42575 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP2P42575 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP2P42575 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP2P42575 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP2P42575 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP2P42575 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP2P42575 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP2P42575 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP2P42575 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP2P42575 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP2P42575 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP2P42575 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP2P42575 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP2P42575 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP2P42575 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP2P42575 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP2P42575 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP2P42575 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP2P42575 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP2P42575 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP2P42575 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP2P42575 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP2P42575 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP2P42575 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP2P42575 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP2P42575 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP2P42575 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP2P42575 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP2P42575 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP2P42575 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP2P42575 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP2P42575 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP2P42575 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP2P42575 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP2P42575 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP2P42575 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP2P42575 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP2P42575 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP2P42575 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP2P42575 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP2P42575 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP2P42575 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP2P42575 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP2P42575 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP2P42575 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP2P42575 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP2P42575 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP2P42575 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP2P42575 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP2P42575 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP2P42575 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP2P42575 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP2P42575 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP2P42575 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP2P42575 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP2P42575 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CASP2P42575 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CASP2P42575 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CASP2P42575 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CASP2P42575 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CASP2P42575 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
CASP2P42575 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CASP2P42575 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP2P42575 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP2P42575 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP2P42575 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP2P42575 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP2P42575 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP2P42575 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP2P42575 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP2P42575 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP2P42575 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP2P42575 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP2P42575 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP2P42575 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP2P42575 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP2P42575 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP2P42575 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP2P42575 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP2P42575 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP2P42575 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP2P42575 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP2P42575 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP2P42575 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP2P42575 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP2P42575 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP2P42575 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP2P42575 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP2P42575 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASP2P42575 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms