Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTN2P35609 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTN2P35609 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTN2P35609 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTN2P35609 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTN2P35609 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTN2P35609 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTN2P35609 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTN2P35609 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTN2P35609 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTN2P35609 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTN2P35609 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTN2P35609 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTN2P35609 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTN2P35609 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTN2P35609 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTN2P35609 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTN2P35609 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTN2P35609 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTN2P35609 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTN2P35609 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTN2P35609 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTN2P35609 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTN2P35609 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTN2P35609 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTN2P35609 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTN2P35609 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTN2P35609 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTN2P35609 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTN2P35609 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTN2P35609 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTN2P35609 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTN2P35609 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTN2P35609 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTN2P35609 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTN2P35609 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTN2P35609 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTN2P35609 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTN2P35609 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTN2P35609 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTN2P35609 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTN2P35609 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTN2P35609 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTN2P35609 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTN2P35609 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTN2P35609 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTN2P35609 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTN2P35609 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTN2P35609 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTN2P35609 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTN2P35609 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTN2P35609 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTN2P35609 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTN2P35609 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTN2P35609 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTN2P35609 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTN2P35609 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTN2P35609 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTN2P35609 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTN2P35609 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTN2P35609 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTN2P35609 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTN2P35609 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTN2P35609 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTN2P35609 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTN2P35609 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTN2P35609 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTN2P35609 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTN2P35609 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTN2P35609 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTN2P35609 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
ACTN2P35609 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ACTN2P35609 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ACTN2P35609 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ACTN2P35609 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ACTN2P35609 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ACTN2P35609 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ACTN2P35609 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ACTN2P35609 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ACTN2P35609 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ACTN2P35609 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ACTN2P35609 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ACTN2P35609 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTN2P35609 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms