Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TSPOP30536 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TSPOP30536 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TSPOP30536 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TSPOP30536 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TSPOP30536 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TSPOP30536 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TSPOP30536 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TSPOP30536 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TSPOP30536 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TSPOP30536 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TSPOP30536 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TSPOP30536 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TSPOP30536 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TSPOP30536 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TSPOP30536 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TSPOP30536 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TSPOP30536 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TSPOP30536 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TSPOP30536 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TSPOP30536 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TSPOP30536 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TSPOP30536 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TSPOP30536 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TSPOP30536 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TSPOP30536 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TSPOP30536 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TSPOP30536 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TSPOP30536 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TSPOP30536 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TSPOP30536 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TSPOP30536 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TSPOP30536 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TSPOP30536 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TSPOP30536 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TSPOP30536 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TSPOP30536 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TSPOP30536 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TSPOP30536 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TSPOP30536 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TSPOP30536 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
TSPOP30536 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TSPOP30536 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TSPOP30536 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TSPOP30536 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TSPOP30536 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TSPOP30536 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TSPOP30536 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TSPOP30536 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TSPOP30536 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TSPOP30536 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TSPOP30536 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TSPOP30536 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TSPOP30536 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TSPOP30536 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TSPOP30536 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TSPOP30536 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TSPOP30536 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
TSPOP30536 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TSPOP30536 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TSPOP30536 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TSPOP30536 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TSPOP30536 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TSPOP30536 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TSPOP30536 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TSPOP30536 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TSPOP30536 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TSPOP30536 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TSPOP30536 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TSPOP30536 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TSPOP30536 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TSPOP30536 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TSPOP30536 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TSPOP30536 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TSPOP30536 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TSPOP30536 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TSPOP30536 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TSPOP30536 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TSPOP30536 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TSPOP30536 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TSPOP30536 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TSPOP30536 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TSPOP30536 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TSPOP30536 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TSPOP30536 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TSPOP30536 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
TSPOP30536 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TSPOP30536 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TSPOP30536 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TSPOP30536 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
TSPOP30536 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TSPOP30536 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TSPOP30536 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
TSPOP30536 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TSPOP30536 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TSPOP30536 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TSPOP30536 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TSPOP30536 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TSPOP30536 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TSPOP30536 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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