Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5F1P24539 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms