Protein–RNA interactions for Protein: P18577

RHCE, Blood group Rh(CE) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHCEP18577 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RHCEP18577 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RHCEP18577 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RHCEP18577 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RHCEP18577 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RHCEP18577 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RHCEP18577 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RHCEP18577 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RHCEP18577 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RHCEP18577 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RHCEP18577 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RHCEP18577 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RHCEP18577 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RHCEP18577 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RHCEP18577 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RHCEP18577 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RHCEP18577 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RHCEP18577 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RHCEP18577 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RHCEP18577 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RHCEP18577 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RHCEP18577 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RHCEP18577 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RHCEP18577 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RHCEP18577 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RHCEP18577 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RHCEP18577 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RHCEP18577 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RHCEP18577 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RHCEP18577 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RHCEP18577 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RHCEP18577 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RHCEP18577 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RHCEP18577 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RHCEP18577 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RHCEP18577 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RHCEP18577 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RHCEP18577 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RHCEP18577 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RHCEP18577 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RHCEP18577 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RHCEP18577 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RHCEP18577 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RHCEP18577 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RHCEP18577 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RHCEP18577 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RHCEP18577 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RHCEP18577 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RHCEP18577 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RHCEP18577 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RHCEP18577 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RHCEP18577 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RHCEP18577 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RHCEP18577 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RHCEP18577 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RHCEP18577 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RHCEP18577 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RHCEP18577 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RHCEP18577 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RHCEP18577 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RHCEP18577 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RHCEP18577 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RHCEP18577 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RHCEP18577 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RHCEP18577 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RHCEP18577 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RHCEP18577 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RHCEP18577 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RHCEP18577 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RHCEP18577 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RHCEP18577 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RHCEP18577 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RHCEP18577 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RHCEP18577 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RHCEP18577 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RHCEP18577 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RHCEP18577 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RHCEP18577 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RHCEP18577 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RHCEP18577 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RHCEP18577 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RHCEP18577 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RHCEP18577 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RHCEP18577 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RHCEP18577 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RHCEP18577 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHCEP18577 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHCEP18577 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHCEP18577 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHCEP18577 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHCEP18577 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHCEP18577 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHCEP18577 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHCEP18577 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHCEP18577 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHCEP18577 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHCEP18577 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHCEP18577 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHCEP18577 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RHCEP18577 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.7 ms