Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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