Protein–RNA interactions for Protein: E9PKD4

NPIPA5, Nuclear pore complex-interacting protein family member A5, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA5E9PKD4 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms