Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

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Length 2,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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CCDC88CQ9P219 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
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CCDC88CQ9P219 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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CCDC88CQ9P219 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC88CQ9P219 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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CCDC88CQ9P219 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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CCDC88CQ9P219 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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CCDC88CQ9P219 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC88CQ9P219 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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