Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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FANCFQ9NPI8 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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FANCFQ9NPI8 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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