Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMARCE1Q969G3 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms