Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVD9

NUDCD3, NudC domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCD3Q8IVD9 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NUDCD3Q8IVD9 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUDCD3Q8IVD9 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUDCD3Q8IVD9 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUDCD3Q8IVD9 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUDCD3Q8IVD9 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUDCD3Q8IVD9 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUDCD3Q8IVD9 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUDCD3Q8IVD9 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUDCD3Q8IVD9 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUDCD3Q8IVD9 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUDCD3Q8IVD9 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUDCD3Q8IVD9 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUDCD3Q8IVD9 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUDCD3Q8IVD9 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUDCD3Q8IVD9 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUDCD3Q8IVD9 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUDCD3Q8IVD9 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUDCD3Q8IVD9 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUDCD3Q8IVD9 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUDCD3Q8IVD9 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUDCD3Q8IVD9 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUDCD3Q8IVD9 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUDCD3Q8IVD9 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUDCD3Q8IVD9 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NUDCD3Q8IVD9 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUDCD3Q8IVD9 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUDCD3Q8IVD9 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUDCD3Q8IVD9 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUDCD3Q8IVD9 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUDCD3Q8IVD9 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUDCD3Q8IVD9 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUDCD3Q8IVD9 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUDCD3Q8IVD9 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUDCD3Q8IVD9 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUDCD3Q8IVD9 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUDCD3Q8IVD9 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUDCD3Q8IVD9 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUDCD3Q8IVD9 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUDCD3Q8IVD9 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUDCD3Q8IVD9 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUDCD3Q8IVD9 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUDCD3Q8IVD9 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUDCD3Q8IVD9 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUDCD3Q8IVD9 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUDCD3Q8IVD9 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUDCD3Q8IVD9 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUDCD3Q8IVD9 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NUDCD3Q8IVD9 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUDCD3Q8IVD9 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUDCD3Q8IVD9 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUDCD3Q8IVD9 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUDCD3Q8IVD9 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUDCD3Q8IVD9 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUDCD3Q8IVD9 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUDCD3Q8IVD9 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUDCD3Q8IVD9 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUDCD3Q8IVD9 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUDCD3Q8IVD9 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUDCD3Q8IVD9 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUDCD3Q8IVD9 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUDCD3Q8IVD9 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUDCD3Q8IVD9 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUDCD3Q8IVD9 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUDCD3Q8IVD9 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUDCD3Q8IVD9 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUDCD3Q8IVD9 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUDCD3Q8IVD9 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUDCD3Q8IVD9 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUDCD3Q8IVD9 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUDCD3Q8IVD9 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUDCD3Q8IVD9 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUDCD3Q8IVD9 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUDCD3Q8IVD9 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUDCD3Q8IVD9 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUDCD3Q8IVD9 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUDCD3Q8IVD9 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUDCD3Q8IVD9 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUDCD3Q8IVD9 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUDCD3Q8IVD9 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUDCD3Q8IVD9 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUDCD3Q8IVD9 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUDCD3Q8IVD9 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUDCD3Q8IVD9 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUDCD3Q8IVD9 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUDCD3Q8IVD9 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUDCD3Q8IVD9 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUDCD3Q8IVD9 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NUDCD3Q8IVD9 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUDCD3Q8IVD9 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUDCD3Q8IVD9 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUDCD3Q8IVD9 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NUDCD3Q8IVD9 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NUDCD3Q8IVD9 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NUDCD3Q8IVD9 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NUDCD3Q8IVD9 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUDCD3Q8IVD9 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NUDCD3Q8IVD9 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUDCD3Q8IVD9 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUDCD3Q8IVD9 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms