Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMU5

TRIM72, Tripartite motif-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM72Q6ZMU5 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM72Q6ZMU5 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM72Q6ZMU5 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM72Q6ZMU5 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM72Q6ZMU5 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM72Q6ZMU5 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM72Q6ZMU5 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM72Q6ZMU5 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM72Q6ZMU5 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM72Q6ZMU5 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM72Q6ZMU5 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM72Q6ZMU5 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM72Q6ZMU5 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM72Q6ZMU5 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM72Q6ZMU5 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM72Q6ZMU5 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM72Q6ZMU5 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM72Q6ZMU5 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM72Q6ZMU5 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM72Q6ZMU5 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM72Q6ZMU5 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM72Q6ZMU5 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM72Q6ZMU5 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM72Q6ZMU5 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM72Q6ZMU5 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM72Q6ZMU5 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM72Q6ZMU5 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM72Q6ZMU5 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM72Q6ZMU5 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM72Q6ZMU5 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM72Q6ZMU5 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM72Q6ZMU5 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM72Q6ZMU5 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM72Q6ZMU5 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM72Q6ZMU5 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM72Q6ZMU5 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM72Q6ZMU5 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM72Q6ZMU5 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM72Q6ZMU5 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM72Q6ZMU5 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM72Q6ZMU5 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM72Q6ZMU5 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM72Q6ZMU5 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM72Q6ZMU5 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM72Q6ZMU5 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM72Q6ZMU5 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM72Q6ZMU5 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM72Q6ZMU5 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM72Q6ZMU5 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM72Q6ZMU5 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM72Q6ZMU5 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM72Q6ZMU5 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM72Q6ZMU5 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM72Q6ZMU5 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM72Q6ZMU5 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM72Q6ZMU5 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM72Q6ZMU5 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM72Q6ZMU5 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM72Q6ZMU5 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM72Q6ZMU5 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM72Q6ZMU5 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM72Q6ZMU5 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM72Q6ZMU5 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM72Q6ZMU5 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM72Q6ZMU5 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM72Q6ZMU5 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM72Q6ZMU5 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM72Q6ZMU5 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM72Q6ZMU5 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM72Q6ZMU5 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM72Q6ZMU5 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM72Q6ZMU5 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM72Q6ZMU5 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM72Q6ZMU5 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM72Q6ZMU5 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM72Q6ZMU5 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM72Q6ZMU5 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM72Q6ZMU5 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM72Q6ZMU5 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM72Q6ZMU5 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM72Q6ZMU5 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM72Q6ZMU5 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM72Q6ZMU5 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM72Q6ZMU5 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM72Q6ZMU5 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM72Q6ZMU5 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM72Q6ZMU5 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM72Q6ZMU5 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM72Q6ZMU5 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM72Q6ZMU5 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM72Q6ZMU5 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM72Q6ZMU5 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM72Q6ZMU5 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM72Q6ZMU5 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM72Q6ZMU5 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM72Q6ZMU5 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM72Q6ZMU5 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM72Q6ZMU5 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM72Q6ZMU5 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM72Q6ZMU5 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms