Protein–RNA interactions for Protein: Q14995

NR1D2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D2Q14995 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NR1D2Q14995 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NR1D2Q14995 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NR1D2Q14995 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NR1D2Q14995 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NR1D2Q14995 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NR1D2Q14995 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NR1D2Q14995 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NR1D2Q14995 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NR1D2Q14995 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NR1D2Q14995 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NR1D2Q14995 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NR1D2Q14995 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NR1D2Q14995 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NR1D2Q14995 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NR1D2Q14995 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NR1D2Q14995 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NR1D2Q14995 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NR1D2Q14995 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NR1D2Q14995 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NR1D2Q14995 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NR1D2Q14995 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NR1D2Q14995 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NR1D2Q14995 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NR1D2Q14995 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NR1D2Q14995 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NR1D2Q14995 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NR1D2Q14995 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NR1D2Q14995 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NR1D2Q14995 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NR1D2Q14995 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NR1D2Q14995 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NR1D2Q14995 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NR1D2Q14995 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NR1D2Q14995 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NR1D2Q14995 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NR1D2Q14995 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NR1D2Q14995 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NR1D2Q14995 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NR1D2Q14995 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NR1D2Q14995 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NR1D2Q14995 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NR1D2Q14995 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NR1D2Q14995 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NR1D2Q14995 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NR1D2Q14995 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NR1D2Q14995 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NR1D2Q14995 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NR1D2Q14995 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NR1D2Q14995 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NR1D2Q14995 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NR1D2Q14995 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NR1D2Q14995 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NR1D2Q14995 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NR1D2Q14995 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NR1D2Q14995 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NR1D2Q14995 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NR1D2Q14995 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NR1D2Q14995 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NR1D2Q14995 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NR1D2Q14995 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NR1D2Q14995 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NR1D2Q14995 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NR1D2Q14995 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NR1D2Q14995 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NR1D2Q14995 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NR1D2Q14995 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NR1D2Q14995 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NR1D2Q14995 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NR1D2Q14995 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NR1D2Q14995 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NR1D2Q14995 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NR1D2Q14995 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NR1D2Q14995 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NR1D2Q14995 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NR1D2Q14995 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NR1D2Q14995 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NR1D2Q14995 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NR1D2Q14995 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NR1D2Q14995 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NR1D2Q14995 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NR1D2Q14995 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NR1D2Q14995 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NR1D2Q14995 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NR1D2Q14995 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NR1D2Q14995 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NR1D2Q14995 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NR1D2Q14995 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NR1D2Q14995 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NR1D2Q14995 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NR1D2Q14995 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NR1D2Q14995 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NR1D2Q14995 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NR1D2Q14995 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NR1D2Q14995 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NR1D2Q14995 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NR1D2Q14995 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NR1D2Q14995 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NR1D2Q14995 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NR1D2Q14995 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms