Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms