Protein–RNA interactions for Protein: P98187

CYP4F8, Cytochrome P450 4F8, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F8P98187 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F8P98187 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F8P98187 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F8P98187 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F8P98187 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F8P98187 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F8P98187 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F8P98187 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F8P98187 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F8P98187 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F8P98187 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F8P98187 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F8P98187 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F8P98187 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F8P98187 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F8P98187 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F8P98187 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F8P98187 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F8P98187 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F8P98187 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F8P98187 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F8P98187 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F8P98187 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F8P98187 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F8P98187 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F8P98187 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F8P98187 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F8P98187 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F8P98187 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F8P98187 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F8P98187 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F8P98187 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F8P98187 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F8P98187 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F8P98187 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F8P98187 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F8P98187 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F8P98187 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F8P98187 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F8P98187 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F8P98187 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F8P98187 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F8P98187 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F8P98187 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F8P98187 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F8P98187 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F8P98187 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F8P98187 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F8P98187 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F8P98187 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F8P98187 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F8P98187 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F8P98187 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F8P98187 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F8P98187 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F8P98187 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F8P98187 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F8P98187 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F8P98187 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F8P98187 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F8P98187 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F8P98187 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F8P98187 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F8P98187 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F8P98187 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F8P98187 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F8P98187 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F8P98187 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F8P98187 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F8P98187 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F8P98187 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F8P98187 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F8P98187 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F8P98187 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F8P98187 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F8P98187 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F8P98187 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F8P98187 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F8P98187 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F8P98187 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F8P98187 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F8P98187 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F8P98187 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F8P98187 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F8P98187 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F8P98187 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F8P98187 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F8P98187 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F8P98187 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYP4F8P98187 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYP4F8P98187 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYP4F8P98187 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYP4F8P98187 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CYP4F8P98187 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYP4F8P98187 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CYP4F8P98187 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYP4F8P98187 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYP4F8P98187 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYP4F8P98187 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYP4F8P98187 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms