Protein–RNA interactions for Protein: P80075

CCL8, C-C motif chemokine 8, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL8P80075 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCL8P80075 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCL8P80075 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCL8P80075 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCL8P80075 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCL8P80075 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCL8P80075 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCL8P80075 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCL8P80075 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCL8P80075 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CCL8P80075 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCL8P80075 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCL8P80075 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCL8P80075 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCL8P80075 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCL8P80075 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCL8P80075 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCL8P80075 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCL8P80075 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCL8P80075 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCL8P80075 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCL8P80075 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CCL8P80075 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCL8P80075 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCL8P80075 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCL8P80075 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCL8P80075 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCL8P80075 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCL8P80075 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCL8P80075 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCL8P80075 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCL8P80075 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCL8P80075 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CCL8P80075 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCL8P80075 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCL8P80075 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCL8P80075 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CCL8P80075 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCL8P80075 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCL8P80075 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCL8P80075 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CCL8P80075 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCL8P80075 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCL8P80075 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCL8P80075 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCL8P80075 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CCL8P80075 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCL8P80075 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCL8P80075 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCL8P80075 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCL8P80075 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCL8P80075 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CCL8P80075 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCL8P80075 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCL8P80075 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CCL8P80075 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCL8P80075 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCL8P80075 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCL8P80075 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCL8P80075 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CCL8P80075 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCL8P80075 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCL8P80075 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCL8P80075 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCL8P80075 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCL8P80075 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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CCL8P80075 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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CCL8P80075 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CCL8P80075 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCL8P80075 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCL8P80075 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCL8P80075 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCL8P80075 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCL8P80075 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCL8P80075 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCL8P80075 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCL8P80075 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCL8P80075 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCL8P80075 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCL8P80075 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CCL8P80075 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCL8P80075 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CCL8P80075 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCL8P80075 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCL8P80075 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CCL8P80075 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCL8P80075 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCL8P80075 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCL8P80075 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCL8P80075 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCL8P80075 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCL8P80075 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCL8P80075 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCL8P80075 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCL8P80075 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCL8P80075 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCL8P80075 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCL8P80075 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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