Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
SMARCA2P51531 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SMARCA2P51531 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms